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机电工程学院发祥于1958年的福建农学院农机系，设有农业工程系、机械工程系、汽车工程系、电气工程系、电子科学系、物理系和工程实训中心等；现有农业工程一级学科博士点、机械工程一级学科硕士点，其中农业工程、机械工程学科为福建省重点学科，农业工程学科还入选了福建省高原学科；拥有农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、车辆工程、电气工程及其自动化、电子科学与技术等五个本科专业。现有在校生1845人（其中本科生1710人，硕士生135人），教职工121人，其中专任教师78人（高级职称36人，具有博士学位39人，有海外留学经历23人），省级研究生导师团队1支，省级本科教学团队1支，校优秀教学团队2支，教育部高等学校教学指导委员会委员1人，省级百千万人才4人，“闽江学者”讲座教授3人。

学院坚持立德树人、德学兼修，强化工科学生的家国情怀、国际视野、法治意识、生态意识和工程伦理意识等，全面落实“学生中心、成果导向、持续改进”的国际工程教育专业认证理念，面向全体学生，关注学习成效，建设质量文化，持续提升工程人才培养水平，着力培养新工科人才“精益求进，追求卓越”的工匠精神。

学院机械装备制造及其自动化专业群入选省级示范项目，机械设计制造及其自动化专业为国家特色专业、福建省人才培养模式创新实验区，并通过了IEET工程认证，车辆工程专业为福建省特色专业，农业机械化及其自动化专业入选福建省服务产业特色专业、福建省创新创业试点专业，大学物理教学实验室为省级实验教学示范中心；学院拥有一批条件优越的实习、实训平台，与湖北十堰东风发动机厂、东南汽车、福大自动化科技、福建上润、福建水口电站等企业合作建立一批高水平的大学生校外实践基地；学院与南非德邦理工大学、台湾中兴大学、台湾海洋大学等签订了多层次联合办学协议。近三年来，学院新增1个省级大学生校外实践基地，1个省级虚拟仿真实验教学项目，承担3项国家教改项目，10项省级教改项目，3门课程入选省级在线开放课程，获得省级教学成果一等奖1项，二等奖3项。

学院建有现代农业装备福建省高校工程研究中心以及机械工程、汽车工程、农业工程、光电子农业工程与技术等四个校级研究所（中心），长期以来，突出农业工程和机械工程的特色，重点围绕山地农业机械设计与实现、农情监测与农业环境调控、光电子农业工程与技术、机电产品设计方法与实现、先进制造与特种材料应用技术、机电控制与汽车电气技术及应用等符合国家和省产业发展方向的基础和应用研究。近年来，学院承接国家、省部级、行业企业科研项目的能力不断增强，承担有国家重点研发项目、国家自然科学基金、省部级重大、重点项目以及企业横向课题等，近三年获得各类科研经费1500多万元，其中省部级及以上科研立项30多项，发表二区以上论文10多篇，最高影响因子达到9.1，还有1篇论文入选2018年ESI高被引论文，授权专利465件，占全校同期的1/3强，合作获得1项省科技进步一等奖，1项省科技进步二等奖，科研成果丰硕。